この図にはアミノ酸配列が22本表示されています。ヒトやラット、酵母等のある種のタンパク質の一部分です。各配列の左側にある見出しは各タンパク質の名前を示しています。アミノ酸は性質が似ているものは同系統の色になるように種類別に色分けされて表示しています。
これはアライメントを行なう前の状態で、ギャップははいっていません。
画面上部には現在のアライメントに対する評価値(スコア)が表示されています。アライメントを行なう前なので、スコアは大変低い値になっています。
アライメントの下の棒グラフは、縦一列のアミノ酸カラムのスコアを表示しています。また、同一カラムに同じアミノ酸が設定したパーセント以上そろっている場合はカラムの下にアミノ酸名(一文字表記)を表示します。
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